2020-03-05 10:25:47
本報訊（李瑩 記者 操戈 鄧衛(wèi)哲）近日，由中國熱帶農(nóng)業(yè)科學院熱帶生物技術研究所國家中藥材產(chǎn)業(yè)技術體系?？诰C合試驗站和中國農(nóng)業(yè)科學院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所崔鵬團隊合作發(fā)布了白木香基因組精細圖譜，相關研究結果已發(fā)表。
基因組精細圖譜的發(fā)布將為野生白木香種群保護生物學、沉香結香機制和香味基因及樹種的進化研究奠定良好基礎，也為進一步基于基因組的白木香分子育種工作提供了可能，在基礎研究及應用領域均具有重要意義。
這項研究利用OxfordNanopore和Il?lumina測序，結合Hi-C數(shù)據(jù)生成了220.61Gb的高質量讀長。組裝后的白木香基因組大小約為726.5Mb，其中716.6Mb的序列被錨定至8條染色體上，ScaffoldN50為88.78Mb，BUSCO分析結果為95.2%。重復序列占基因組的比例為59.13%，共注釋了29203個蛋白質編碼基因。根據(jù)單拷貝基因的系統(tǒng)發(fā)育和分化時間估算，發(fā)現(xiàn)白木香與其在錦葵目的最近共同祖先大約在53.18-84.37百萬年前分開。
據(jù)介紹，白木香是瑞香科中第一個基因組組裝至染色體水平的物種，隨著后期更多個性化數(shù)據(jù)的裝配和分析，新版基因組圖譜將持續(xù)保持更新。
白木香是傳統(tǒng)名貴藥材和天然香料“沉香”的重要基源植物，主要分布于中國南部的熱帶及亞熱帶地區(qū)。在自然條件下，僅有7%-10%的白木香可以結香，且形成過程極為緩慢，通常需要數(shù)十年。良好的醫(yī)藥價值和巨大的經(jīng)濟效益，導致了對白木香的掠奪式采伐，其野生資源已日漸枯竭。野生白木香是國家II級保護植物、被《中國生物多樣性紅色名錄（高等植物卷）》和IUCNRedlist列為易危物種，收錄在CITES附錄二中。
海南省政府對沉香產(chǎn)業(yè)高度重視，為全面推動海南沉香產(chǎn)業(yè)發(fā)展，近年來相繼印發(fā)《海南省沉香產(chǎn)業(yè)發(fā)展規(guī)劃（2018-2025年）》和《海南省推進沉香產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新發(fā)展工作方案》，就規(guī)范沉香科學種植、提升科技創(chuàng)新能力、推動產(chǎn)業(yè)高質量發(fā)展、完善市場建設等方面提出明確任務，提出要逐步把海南省建設成為世界優(yōu)質沉香原料基地、全國最大的精深加工生產(chǎn)基地和貿(mào)易中心。
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