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首個茶樹泛基因組圖譜發(fā)布

2023-12-12 09:44:23   

11日,記者從中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所獲悉,該所聯(lián)合國內(nèi)多家單位成功構(gòu)建了茶樹首個泛基因組圖譜,同時完成了22個茶樹品種的測序。相關(guān)研究成果日前發(fā)表在國際權(quán)威期刊《自然·植物》上。

茶樹是重要的經(jīng)濟(jì)作物,傳統(tǒng)茶樹育種主要通過雜交和自然變異選育優(yōu)良品種,育種周期長。如何更加精確、高效地育種一直是茶樹育種家關(guān)注的焦點。利用泛基因組輔助育種技術(shù),有望實現(xiàn)更快速的植物性狀改良。

“研究選取了22個能最大化代表茶樹遺傳多樣性和表型多樣性的茶樹品種,包括大葉茶、小葉茶和白毛茶進(jìn)行測序組裝,得到了完整的茶樹泛基因組圖譜。結(jié)合圖形泛基因組、群體基因組學(xué)以及代謝組數(shù)據(jù)進(jìn)行綜合分析,研究還鑒定到多個影響茶葉風(fēng)味性狀的等位變異(在一個基因或基因組中發(fā)現(xiàn)的新發(fā)生的突變或變異形式),進(jìn)一步揭示了茶樹基因組擴(kuò)張的遺傳基礎(chǔ);鑒定得到多個與茶葉顏色、香氣等農(nóng)藝性狀相關(guān)的關(guān)鍵基因,為茶樹育種打下重要基礎(chǔ)?!闭撐耐ㄓ嵶髡摺⒅袊r(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所研究員張興坦告訴科技日報記者。

據(jù)悉,茶樹泛基因組圖譜的構(gòu)建更新了大眾對茶樹基因組的認(rèn)識,包括蛋白編碼基因數(shù)以及遺傳變異對茶樹表型的影響。該研究不僅為茶樹基因組和重要性狀的演化提供新見解,而且為茶樹重要基因挖掘和遺傳育種提供了重要平臺資源和信息,為加速茶樹育種進(jìn)入全基因組設(shè)計時代奠定了重要基礎(chǔ)。

來源:科技日報
編輯:張靜
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